Nakon provedene analize s ciljem racionalizacije sustava javne uprave, predlaže se pripajanje Fonda za naknadu oduzete imovine Ministarstvu financija na način da se poslovi Fonda obavljaju u okviru zasebne ustrojstvene jedinice Ministarstva financija, te se u tom smislu predlaže da se Zakon o Fondu za naknadu oduzete imovine stavi van snage.Tim se zakonskim prijedlogom predviđa provođenje aktivnosti utvrđenih u Nacionalnom programu reformi za 2016..
Fond je, kako se ističe u prijedlogu, u dosadašnjem radu učinkovito obavljao svoje zadaće: isplatu naknade u novcu i obveznicama RH ovlaštenicima naknade temeljem pravomoćnih rješenja o naknadi za oduzetu imovinu, prodaju nacionaliziranih i konfisciranih stanova nositeljima stanarskog prava odnosno zaštićenim najmoprimcima, prikupljanje sredstava ostvarenih prodajom stanova.Također, bavio se evidencijom prodanih stanova i praćenjem naplate, evidencijom hipotekarnih dužnika i izradom brisovnih očitovanja, izdavanjem Globalne obveznice RH za naknadu imovine oduzete za vrijeme jugoslavenske komunističke vladavine, sudjelovanjem u provođenju Ugovora između Svete Stolice i RH o gospodarskim pitanjima.No, kako sama aktivnost Fonda opada njegove bi poslove u buduće trebala obavljati zasebna ustrojstvena jedinica.